朝陽專業魚蝦飼料供應中蛋白質是必不可少的成分，蛋白質是由各種胺基酸所構成，是魚類生長、發育及繁殖所必須的養分，也是構成生物細胞的主要成分。魚類的肌肉組織、皮膚、神經及內臟器官的構成也大都以蛋白質為主，蛋白質也能變成酵素和激素在動物體內擔任重要的功能。若專業魚蝦飼料供應中缺乏碳水化合物時蛋白質可轉為熱能使用。市售的觀賞魚飼 料都有標示蛋白質含量，肉食性或偏肉食性魚需要 較高的蛋白質，含量在４０％以上即可符所需；雜食性魚３５％左右即可；偏素食性魚類其腸子較長 可讓食物儲藏較久，蛋白質含量可低些，約３０％ 左右適當。而蛋白質可分為〝動物性蛋白質〞與〝 植物性蛋白質〞，分別含于魚粉、蝦粉或大豆粉等食物中；肉食性或偏肉食性魚較喜歡動物性蛋白質 ，偏素食性魚較喜歡植物性蛋白質，雜食性魚兩種混合即可。

用可利用營養素為指標(如可消化氨基酸、有效磷等)設計專業魚蝦飼料供應配方的基礎是要有各種飼料原料的可利用營養素含量數據。設計者應盡可能合理利用這些數據。不過，飼料企業在實際配制專業魚蝦飼料供應時所用的飼料原料的可利用營養素含量與文獻報道的數據還是有一定出入。設計人員應該在對所用飼料原料化學分析的基礎上進行配方設計。采用配制劑提高飼料營養成分的消化率，酶制劑在水產飼料中的應用已有許多成功的例子。纖維素酶、木聚糖酶、淀粉酶、蛋白酶、植酸酶、果膠酶等是飼料中添加較多的酶。添加酶制劑既可以提高飼料的可消化能量，又可以提高動物對酶作用物質的消化率。通常對于幼魚，由于其消化系統尚未發育成熟，某些消化酶的分泌不足。此時添加復合酶制劑可以提高飼料的消化率和魚生產性能。而當飼料配方中含有魚蝦不適宜消化的原料組分時，添加專用酶制劑也會有明顯的效果。谷物及其副產品中植酸磷的含量較高，但動物對桓酸磷的利用率很低。在水產飼料中添加桓酸酶也可提高桓酸磷的利用率，同時可改進飼料的轉化效率。

魚類消化腺不發達，各種消化酶因體溫低而不能充分發揮其較佳活性；腸道中起消化作用的細菌種類少，數量也不多；食物在魚類消化道的停留時間(食物通過時間或排空時間)明顯短于畜禽，豬為72~96小時，禽為48小時，大馬哈魚為15~26小時，胡子鯰為24小時。通常畜禽飼料的原料細度要求全部通過8目，16目篩上物不大于20%，而普通朝陽魚蝦飼料供應原料要求全部通過40日，60目篩上物不得超過20%，而普通水產料(如對蝦、鰻魚飼料原料)要求全部通過60目，其幼體所需的原料粉碎粒度則更小，要求全部通過80目。目前，雖然觀賞魚飼料的粉碎細度還沒有明確要求，但較細的粉碎粒度有利于規件觀賞魚對營養物質的消化吸收率，也有利于提高飼料的混合均勻性觀賞和顆粒成型率，并直接影響朝陽魚蝦飼料供應顆粒在水中的穩定性。

專業魚蝦飼料供應廠家攝取的蛋白質過多，消化利用不了的蛋白質就會以氮元素的形式排出體外，既降低了機體對蛋白質的利用效率，又加重了水質管理的壓力，同時也易引起腸道疾病的發生。在相對適宜的蛋白質水平條件下，氨基酸平衡不僅會使魚蝦獲得較快的生長速度，而且其免疫力也會有所增強。脂肪對魚蝦免疫機能的影響。脂肪尤其是必需脂肪酸是魚蝦免疫反應的重要調節因子。日糧中添加必需脂肪酸可以提高動物機體的體液免疫能力和細胞免疫能力，可以促進細胞免疫因子的產生，對有絲分裂刺激的淋巴細胞增殖反應產生重要影響，可以增強巨噬細胞的吞噬能力。蛋白質和脂肪是專業魚蝦飼料供應廠家的重要組成部分。